应用化学系拥有应用化学博士点，有机化学硕士点,应用化学硕士点和分析化学硕士点。每年培养应用化学本科生约100名，硕士研究生约40，博士研究生近10名，形成了现代分析、精细有机合成、胶体和表面化学、水化学和水处理技术四个特色的专业方向。应用化学专业是一个就业面非常广泛的学科，学生在近几年的分配中就业率达95％，是社会上非常需要的专业人才。
    化学实验中心是江苏省基础课实验教学示范中心和国家实验教学示范中心建设点，拥有元素分析仪、高效液相色谱、等离子光谱分析仪、在线红外、分子荧光光谱等大型仪器，有较强的教学和科学研究的实力。
    近年来在教学和科研方面取得了令人满意的成绩，获得国家科技进步二等奖1项和省部级奖励4项。已形成了有机合成化学、水化学、有机功能材料化学和环境分析化学等富有鲜明特色的研究方向，为今后学科发展奠定了扎实的基础。出版了和专业相关的《无机与分析化学教程》、《仪器化学》、《应用化学专业英语教程》等8部教材。“十五”期间完成了国家“863”项目1项，国家自然科学基金项目2项，国家“十五”重点攻关项目2项，省重点攻关等项目多项，年均科研经费到款300万元以上，发表论文40篇以上， SCI文章超过10篇/年，专利授权8项，国际专利二件。 
     物理学科
    物理学是自然科学中发展较完善和快速的基础学科，经过二十世纪的飞速发展，物理学已取得了辉煌的成就，为人类认识自然提供了相当丰富的理论知识，对人类文明的进步起到了不可估量的作用。如今，物理学的前沿探索领域已伸向复杂体系、基本粒子、宇宙深处，正在揭示自然界中的最基本的秘密。应用物理学是把已取得的物理学理论和知识与生产实践相结合，侧重于人类改造自然的技术进步。二十一世纪，是一个高新技术及产业高速发展的时期，是一个提升传统产业技术的关键时期，应用物理学的发展为我们实现这个目标提供了有利的条件。
    南京工业大学理学院应用物理学专业是为了适应国家的经济建设和高新技术产业发展的需要而设置的新专业。早在上世纪八十年代，南京工业大学的物理教研室就与本校的材料学院合作，联合招收培养硕士研究生，在材料的性能测试技术、材料物理等方面培养了一批研究生，在高温超导材料的研究领域处于国内领先水平。经过二十多年的积累和发展，我们在应用物理学教学和研究方面取得了丰富的经验。应用物理学本科专业于2003年面向全国招生。目前已有的教学设备包括：X射线仪、振动样品磁强计、功率超声设备、成套的静电测试设备、光能量测试仪微波实验设备等。
    在科学研究方面，近几年来先后承担和参与了国家自然科学基金项目“高压下导电高聚物的合成与性能检测”、总装备部的“有机/无机纳米复合材料的制备及性能测试”等，这对应用物理学专业的建设与发展起到了积极的作用。 
    数学学科
    随着科学技术的不断进步，数学迅速向自然科学和社会科学的各个领域渗透，在工程技术、信息产业、经济建设及金融管理等各个方面发挥着越来越重要的作用。大量信息的处理和高科技成就的取得都离不开数学这门学科，正如许多科技界的有识之士所指出的，现代科技的竞争归根到底到是数学的竞争。我校的数学学科包含两个专业：信息与计算科学、数学与应用数学专业。数学与应用数学专业培养的人才具有较宽厚的数学基础、广泛的适应性和熟练的计算机编程能力。而信息与计算科学是由信息科学、计算数学与计算机科学技术结合与交叉渗透而形成的新型专业。
    二十世纪九十年代以来，我们在信号处理算法长期研究的基础上，取得了应用上的重要进展。此外，在运筹优化及复杂系统的演化计算方面取得了相关成果，由此形成了相对稳定且具有一定特色的学科方向。数学与应用数学专业我们的方向确定在金融数学和应用统计。